উদ্ভিদ শ্রেণীবিন্যাস সম্পর্কিত গবেষণার মূল প্রতিপাদ্য বিষয়  হল-উদ্ভিদ প্রজাতি সনাক্তকরণ, শ্রেণী বিন্যাসকরণ, নতুন উদ্ভিদ প্রজাতি আবিস্কার ও তাহার নামকরণ, এবং বিভিন্ন প্রজাতির উদ্ভিদের মধ্যে পারস্পারিক সাদৃশ্য/বৈসাদৃশ্য ও সম্পর্ক নির্ণয়করণ। মাঠপযার্য়ে জরিপের মাধ্যমে সংগৃহীত উদ্ভিদ নমুনাগুলো সনাক্তকরণের জন্য হারবেরিয়ামের বিজ্ঞানীগণ উদ্ভিদের মূল, কান্ড, পাতা, ফুল, ফল ইত্যাদি অংশ ব্যবচ্ছেদকরণের পর অণুবীক্ষণ যন্ত্রের সাহায্যে এর বিভিন্ন বৈশিষ্ট্যসমূহ পর্যবেক্ষণ করে থাকেন। এরপর হারবেরিয়াম কাপর্বোড-এ সঠিকভাবে সনাক্তকৃত সংরক্ষিত উদ্ভিদ নমুনা এবং নির্ভরযোগ্য ফ্লোরার সাথে পর্যবেক্ষণকৃত বৈশিষ্ট্যসমূহের তুলনা করে সংগৃহীত উদ্ভিদ প্রজাতিগুলো সনাক্ত করা হয়। অত:পর উদ্ভিদ প্রজাতিগুলো শ্রেণীবিন্যাসপূর্বক হারবেরিয়াম কাপর্বোড-এ সংরক্ষণ করা হয়। বিভিন্ন উদ্ভিদ প্রজাতির মধ্যে পারস্পারিক সাদৃশ্য/বৈসাদৃশ্য ও সম্পর্ক নির্ণয়ের জন্য হারবেরিয়ামের ল্যাবরেটরীতে ট্যাক্সোনমিক্যাল গবেষণার পাশাপাশি সাইটোলজিক্যাল ও এনাটমিক্যাল গবেষণা পরিচালনা করা হয়। যে সকল উদ্ভিদ প্রজাতির বৈশিষ্ট্য ট্যাক্সোনমিক্যাল গবেষণার মাধ্যমে ইতোমধ্যে আবিস্কৃত অন্য কোন উদ্ভিদ প্রজাতির সাথে সাদৃশ্যপূর্ণ নয় সে গুলোকে নতুন প্রজাতি হিসেবে বর্ণনা করা হয়।